Геймери грають "EteRNA" просто перевершити професійну науку до цього вирішального відкриття

Громадянина наука лише пішла на наступний рівень: відеоплеєри зробили біологічне відкриття, і тепер його опублікував рецензований науковий журнал.

Опубліковано на цьому тижні в Росії Журнал молекулярної біології, серія інтуїтивно розроблених правил для того, наскільки складно буде досягти певної форми за допомогою дизайну РНК. Вони, наприклад, виявили, що чим більше симетрична форма, тим складніше буде створити нитку РНК, яка б відповідала йому.

Колектив відео-геймерів зробив відкриття, граючи, EteRNA, Гра, яка змушує гравців брати нитки РНК і складати їх у бажану форму, змінюючи їх хімічний склад. Наукова проблема складання РНК в певну форму є складною, але гра не є - не потрібно розуміння біохімії, щоб почати грати.

Геймери взялися за дослідницьке питання за своєю власною ініціативою, як спосіб надання новим гравцям інструментів, щоб судити про відносну складність різних головоломок. Отримані дані допоможуть в майбутньому біомедичному дослідженні, оскільки новий набір правил дає вченим краще розуміння того, чи намагається РНК перетворитись у задану форму - це марна вправа.

"Це дослідження показує, що стандартна парадигма наукового краудсорсингу може бути перевернута", - розповідає професор біохімії в Стенфорді Rhiju Das. Обернено електронною поштою. EteRNA був запущений в 2011 році Das і Адрієн Треіл, доцент кафедри інформатики в Університеті Карнегі-Меллона. “ EteRNA гравці можуть розробляти власні дослідницькі питання і можуть писати власні статті. У цьому дослідженні було невелике керівництво та незалежне тестування від експертів у моїй лабораторії.

Синтезована РНК володіє неймовірним потенціалом для нового покоління лікарських засобів і медичних терапій. Якщо він може бути складений у правильну форму, РНК може бути побудована для націлювання на певні віруси, раки і навіть генетичні порушення. CRISPR, процес редагування генів, який може істотно змінити майбутнє людського існування, використовує РНК, щоб направляти фермент, що розрізає ДНК, Cas9, до небажаного ділянки ДНК.

EteRNA розпочався як форум для вчених-експертів, щоб представити головоломки геймерам, але з тих пір він зростав. Гра та її 100 000 зареєстрованих гравців тепер існують у симбіотичних і розвиваються відносинах з професійними вченими і комп'ютерними моделями, побудованими для розробки і тестування структури РНК.

«Комп'ютерне моделювання і EteRNA не є винятковим, - говорить Дас. “ EteRNA об'єднує багато людей, деякі з яких пишуть свої власні комп'ютерні моделі ».

У поточному документі гравці спільно написали сценарії, щоб перевірити свої ідеї, що робить структуру РНК складною для проектування. Das каже, що деякі гравці розповіли йому, що вони особливо раді автоматизувати свої ідеї в комп'ютерні моделі, тому що вони хочуть продовжувати і вирішувати більш складні проблеми.

Проблеми побудовані EteRNA гравці фактично продовжують синтезуватись у лабораторії Das - до цього часу було побудовано 86 459 послідовностей, створених програвачем.

Провідними авторами статті були EteRNA геймери Джефф Андерсон-Лі, Елі Фіскер, Вінеет Косараю і Мішель Ву. Ву також є кандидатом наук. студент біомедичної інформатики в Стенфорді.

У майбутньому може бути, що експерти-громадяни починають публікувати наукові відкриття повністю самостійно.

Цей шаблон "перевернутого краудсорсингу" для громадянської науки може бути корисним для інших проектів і галузей науки, таких як астрономія (Зоопарк Галактики), або ідентифікація видів, отриманих з натовпу Штрих-код життя), - говорить Дас. - Особливо, якщо вони EteRNA, бачать вузькі місця на етапі написання паперу."