Послідовність генома чорного носорога може зберегти види від вимирання

ХХІ століття - це чудовий час бути біоінженером і жахливим часом, щоб стати чорним носорогом. Африканський вид, який налічував 850 тис. Років тому, скорочувався до швидкого зменшення чисельності населення близько 5000 чоловік. В надії одного дня перемотати цей катастрофічний спад, біологи намагаються перекрити послідовність diceros bicornis bicornis геном.

Проект є спільним зусиллям кількох експертів, що займаються питаннями збереження, та включають біологічного фахівця з університету Вашингтона доктора Чарльза Мюррея та Метью Маркуса, генерального директора Pembient. Pembient є біотехнологічною компанією в Сан-Франциско, яка хоче затопити китайські ринки синтетичним - але біологічно ідентичним - рогом носорога, 3D, надрукованим з лабораторного кератину і, можливо, поставленим як пиво носорога. (Кератин - це те, з чого роблять ваші нігті і роги носорога. Він не є ні магічним, ні лікарським.) Пембієнт міг навчитися достатньо з генома одного носорога на ім'я Нтомі, сказав Маркус Обернено, щоб уточнити спосіб його синтезу білків носорога.

Але перш ніж хтось зможе обробити генетику Ntombi для отримання даних, спершу слід секвенувати геном чорного носорога. Проект приблизно на півдорозі до підвищення $ 16,500 на Experiment.com, crowdfunding платформа на зразок Kickstarter за винятком науки, а не воскресіння давно мертвих відеоігор.

"Є ще відносно невелика кількість організмів, геноми яких прослідковуються", - говорить Мюррей. "До недавнього часу це було дуже важко - трудомістким і дорогим".

Це не означає, що тварини не роблять своїх геномів. Проект «Геном 10K» спрямований на збір генетичних даних Ноєвого ковчега. А південний білий носоріг, більш густонаселений і більш великий вид, мав послідовність геномів у 2012 році. А як щодо чорних носорогів, таких як Ntombi? "Незрозуміло, чому чорні носороги так довго залишалися на стороні", - каже Маркус. Він виганяє бездіяльність до випадковості; але, можливо, через те, що південні білки вже прослідковувалися, чорний носоріг не був пріоритетом.

Маркус, Мюррей і їхні співробітники прагнуть припинити цей розрив. Ntombi, плакат носорога для проекту, вже мали кров і зберегли - і, бінго! ДНК-носоріг. Послідовність повинна бути досить простою, сказав Мюррей. "Великою допомогою є те, що геном білого носорога є еталоном".

Наступні кроки в послідовності

З ДНК Ntombi, розміщеної на серверах DNAnexsus, біологи заклали фундамент для порівняльної геноміки носорога. "Як тільки ми отримаємо її послідовність, ми можемо почати розуміти, що робить носорога носорогом, як білий відрізняється від чорного", говорить Мюррей, "і надавати інформацію, яка допоможе відслідковувати прикордонні зразки".

Ветеринари можуть перевірити гени, які викликають потенційно хворобу, та мати базову лінію для порівняння інших семи чорних підвидів носорога - три з яких вже вимерли.

Тварини після завтрашнього дня

Як тільки ми маємо більш чітке розуміння генетики чорного носорога, відкриваються кілька теоретичних дверей. "По дорозі я збуджуюся про використання стовбурових клітин, щоб зрозуміти фізіологію носорога і, потенційно, вирощувати роги носорога в лабораторії, щоб зменшити браконьєрство", говорить Мюррей.

Маркус прогнозує трохи далі. Для diceros bicornis bicornis Маркус не бачить настільки сильного розпаду мамонтового стилю, а повертає генетичний годинник; чим менша кількість населення, тим більш схильними є успадковані проблеми.

А для чорних носорогів, які пішли? Він порівнює ці зусилля з такою послідовністю генома північного білого носорога, що триває в зоопарку Сан-Дієго. Є розмови про те, щоб спробувати отримати південний білий носоріг (з них 20 тисяч), щоб носити північний білий носоріг (з них 5) до терміну. Маркус говорить з обережним, обережним оптимізмом: "Потенційно - потенційно - можливо, що вимерлі підвид чорного носорога знову можуть бути реалізовані".